公司申報營利事業所得稅若想適用盈虧互抵，須符合三大要件，第一是會計帳冊簿據完備，第二是虧損及申報扣除年度都使用「藍色申報書」，或經會計師查核簽證，第三必須如期申報。三條件都符合才能適用盈虧互抵。

財政部北區國稅局表示，針對公司組織的營利事業，《所得稅法》訂有盈虧互抵機制，若符合一定條件，可將前十年核定虧損，從年度純益額中扣除後再課稅。

國稅局官員指出，對於「會計帳冊簿據完備」之要求，必須是「無瑕疵」申報才算數，若有短漏報所得，則視為有瑕疵，原則上將不符合會計帳冊簿據完備，除非短漏報情節屬於輕微，才有機會適用盈虧互抵。

根據財政部解釋令，所謂情節輕微是指，申報扣除年度或虧損年度漏報稅額不超過10萬元，或短漏報所得占全年核定虧損金額比率不超過5%；此外若在被稽徵機關調查前，公司自動補報，漏報稅額不超過20萬元、漏報所得占比不超過10%，也算情節輕微，仍可適用盈虧互抵。

北區國稅局有一案例，某經營國產家具零售公司，106年度營所稅所得額337.8萬元，申報時列報102年度虧損337.8萬元，最終申報106年度課稅所得為0元。

後來國稅局查到這家公司在102年度曾漏開統一發票，漏報銷貨收入及所得額各為98萬元，不符合情節輕微標準，短漏報所得導致不符「會計帳冊簿據完備」要件，國稅局不准列報虧損，核定稅額57萬餘元。

這家公司後來告到法院，認為雖有漏報事實，但不准盈虧互抵不合常理，經過高等法院、最高法院，最後都遭駁回。國稅局表示，這家公司短漏報情節不算輕微，且帳載缺漏不完備且不正確，未據實以報，無法適用盈虧互抵。官員也表示，另外一項要件是如期申報，特別留意，是包括虧損及申報扣除年度都要如期申報，才能適用，若有逾期申報狀況，將不符合要件。

國稅局提醒，營利事業適用盈虧互抵規定，申報扣除前十年核定虧損時，應注意符合所得稅法規定適用要件，以免因不符合規定而遭補稅及加計利息。...