財政部北區國稅局表示，作農業使用之農業用地及其地上農作物，由繼承人或受遺贈人承受者，其土地及地上農作物之價值，免徵遺產稅，但應檢具繼承時農業主管機關核發之有效期間「農業用地作農業使用證明書」，再向稽徵機關申請遺產稅之農業用地扣除額。
北區國稅局舉例說明，轄內李君於100年3月辦理其父遺產稅申報，未列報遺產土地屬於農業用地，業經核發免稅證明書在案。嗣李君於105年1月另補申報經法院判決確定之被繼承人對第三人土地登記返還請求權，同時申請增列農業用地扣除額，並提示轄內區公所105年1月20日核發之農地農用證明及自100年至104年間之航測影像照片等資料，主張被繼承人遺留之土地實際為農業使用。
因農業用地作農業使用證明書載明有效期間6個月，李君所提示之105年1月20日農地農用證明僅能證明所申請之土地在該證明書核發時點，係作農業使用，無法溯及證明100年3月間確作農業使用。是以，因無農業主管機關證明被繼承人死亡時該農業用地之使用狀態，稽徵機關亦難據以認定，故依法否准認列農地扣除額。
北區國稅局特別提醒，農業用地作農業使用之認定及核發證明作業，係以「農業用地作農業使用證明書」為其證據方法，為法所明定事項，繼承人應檢具繼承時農業主管機關核發之「農業用地作農業使用證明書」，俾申請適用農業用地扣除額，免徵遺產稅。
有關「農業用地作農業使用證明書」用途：減免稅賦方面，農業發展條例第三十七條及第三十八條農業用地可以申請不課徵土地增值稅、免徵遺產稅、贈與稅。因此有關不得認定為作農業使用之情形，所有權人需提早了解，以便於日後順利申請，且此證明文件之有效期限為六個月。有關遺產與贈與稅規劃需要諮詢者，可洽專業會計師商談。
